Artículos

38. Mroue-Ruiz FH, Pacheco-Sandoval A, Lago-Lestón A, Giffard-Mena I , Abadía-Cardoso A, Chong-Robles J , Schramm Y (2022) Metabarcoding analysis as a better approach for prey identification of wild Totoaba macdonaldi. To be submitted to Integrative and Comparative Biology.

37. Pacheco-Sandoval A, Lago-Lestón A, Solano E, Abadía-Cardoso A (2022) Age as a primary driver of the microbial composition in wild harbor seals.  Submitted to Scientific Reports.

36. Fernández-López M, Sánchez-Reyes A, Barcelos C, Sidon-Ceseña K, Lago-Lestón A (2022) PKS gene diversity from deep-sea sediment metagenomes of southern Gulf of Mexico. Submitted to Antibiotics


35. Jimenez-Gómez I, Valdés-Muñoz G, Moreno-Ulloa A, Pérez-Llano Y, Moreno-Perlin T, Silva-Jiménez H, Barreto-Curiel F, Sanchez-Carbente MR, Folch-Mallol JL, Gunde-Cimerman N, Lago-Lestón A, Batista-García RA (2022). Surviving in the brine: a multi-omics approach for understanding the physiology and metabolism of the halophile fungus Aspergillus sydowii at saturated NaCl concentration. Frontiers in Microbiology. 13:840408. DOI: 10.3389/fmicb.2022.840408.

 

34. Torres-Beltrán M, Vargas-Gastelúm Ll, Magdaleno-Moncayo D, Riquelme M, Herguera-García JC, Prieto-Davó A, Lago-Lestón A. (2021) Metabolic and ecological insights of the microbial community from the southern Gulf of Mexico deep-sea sediments. PeerJ 9:e12474. DOI:10.7717/peerj.12474

33. Castañeda-Quezada R, García-Mendoza E, Ramírez-Mendoza R, Helenes J, Rivas D, Romo-Curiel A, Lago-Lestón A (2021). Distribution of Gymnodinium catenatum Graham cysts and its relation to harmful algae blooms in the northern Gulf of California. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 1-15. DOI:10.1017/S0025315421000795.

32. Vargas-Albores F, Martínez-Córdova LR, Hernández-Mendoza A, Cicala F, Lago-Lestón A, Martínez-Porchas M. (2021). Therapeutic modulation of gut microbiota, a feasible strategy for aquaculture? Aquaculture 544, 737050. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2021.737050

31. Valenzuela-Gutiérrez R, Lago-Lestón A, Vargas-Albores F, Cicala F, Martínez-Porchas (2021) Exploring the garlic (Allium sativum) properties for fish aquaculture (2021). Fish Physiology and Biochemistry 47, 1179–1198. DOI: 10.1007/s10695-021-00952-7.

30. Raimundo I, Silva R, Meunier L, Valente SM, Lago-Lestón A, Keller-Costa T. and Costa R. (2021). Functional metagenomics reveals differential chitin degradation and utilization features across free-living and host-associated marine microbiomes. Microbiome 9, 43. DOI: 10.1186/s40168-020-00970-2

29. Keller-Costa T, Lago-Lestón A, Saraiva JP, Toscan RB; Silva SG, Gonçalves J, Cox CJ, Kyrpides N, Nunes da Rocha U, Costa R. (2021) Metagenomic insights into the taxonomy, function, and dysbiosis of prokaryotic communities in octocorals. Microbiome 9, 72. DOI: 10.1186/s40168-021-01031-y

28. Martínez-Porchas M, Lafarga-De la Cruz F, Aguilera F, Cicala F, Lago-Lestón A. (2020) Water microbiota is not affected by stocking density of the yellowtail kingfish (Seriola lalandi) in a recirculation system. Aquaculture Research. 2021;52:410–414. DOI: 10.1111/are.14883

27. Cicala F, Lago-Lestón A, Gomez-Gil B, Chong-Robles J, Cortés-Jacinto E, Martínez-Porchas M. (2020) Gut microbiota shifts in the giant tiger shrimp, Penaeus monodon, during postlarvae, juvenile and adult stages. Aquaculture International 28, 1421–1433. DOI: 10.1007/s10499-020-00532-1

26. Marques  M, Godinho Silva S, Borges N, Nunes da Rocha U, Lago-Lestón A, Keller-Costa T, Costa R. (2020) Metagenome-Assembled Genome Sequences of Three Uncultured Planktomarina sp. Strains from the North-East Atlantic Ocean. Microbiology Resource Announcements  9 (12): e00127-20. DOI: 10.1128/MRA.00127-20 s.

29. Garibay-Valdez E, Calderón K, Vargas-Albores F, Lago-Lestón A, Martínez-Córdova LR and Martínez-Porchas M (2019) Functional Metagenomics for Rhizospheric Soil in Agricultural Systems. In: Tripathi V, Kumar P, Tripathi P, Kishore A (eds) Microbial Genomics in Sustainable Agroecosystems. Springer, Singapore pp 149-160. ISBN: 978-981-13-8739-5

28. Linacre L, Durazo R, Camacho-Ibar V, Selph KE, Lara-Lara J.R., Mirabal-Gómez U, Bazán-Guzmán C, Lago-Lestón A, Fernández-Martín EM, Sidón-Ceseña K. (2019) Picoplankton carbon biomass assessments and distribution of Prochlorococcus ecotypes linked to Loop Current Eddies during summer in the southern Gulf of Mexico. Journal of Geophysical Research Oceans,124, 8342–8359 DOI: 10.1029/2019JC015103

27. Pacheco-Sandoval A., Schramm. Y., Heckel. G., Brassea-Pérez. E., Martínez-Porchas, Lago-Lestón A. (2019). The Pacific harbor seal gut microbiota in Mexico: its relationship with diet and functional inferences.  PLoS ONE 14(8):e0221770. DOI: 10.1371/journal.pone.0221770.

26. Romero-Olivares A.L. Meléndrez-Carballo G., Lago-Lestón  A. and Treseder K.K. (2019). Soil metatranscriptomes under long-term experimental warming: fungi allocate resources to metabolism rather than decay.  Frontiers in Microbiology, 10: 1914. DOI:10.3389/fmicb.2019.01914

25. Vargas-Gastélum Ll., Chong-Robles J., Lago-Lestón A., Darcy J.L., Amend A. and Riquelme M. (2109). Targeted ITS1 sequencing unravels the mycodiversity of deep-sea sediments from the Gulf of Mexico. Environmental Microbiology. DOI: 10.1111/1462-2920.14754

24. Brassea-Pérez E, Schramm Y, Heckel G, Chong-Robles J and Lago-Lestón A. (2019). Metabarcoding analysis of the Pacific harbor seal diet in Mexico. Marine Biology 166: 106. DOI:10.1007/s00227-019-3555-8

23. Carvajal Millan E., Vargas-Albores F., Gollas-Galvan T., Fierro-Islas M, Magdaleno-Moncayo D, Rascon-Chu, A; Martinez-Porchas M, Lago-Lestón, A.  (2019) Arabinoxylans and gelled arabinoxylans used as anti-obesogenic agents could protect the stability of intestinal microbiota of rats consuming high-fat diets. Journal of Agricultural and Food Chemistry 6:1-10. doi: 10.1080/09637486.2019.1610729.

22. Juárez O.E.,  López-Galindo L.L., Pérez-Carrasco L., Lago-Lestón A., Rosas C., Di Cosmo A., Galindo-Sánchez C.E. (2019). Octopus maya white body show sex-specific transcriptomic profiles during the reproductive phase, with high differentiation in signaling pathways. Accepted to PloS One (manuscript ID: PONE-D-19-01412)

21. López-Galindo L.L., Juárez O.E., Larios-Soriano E., Del Vecchio G., Ventura-López C., Lago-Lestón A. and Galindo-Sánchez  C.E. (2019). Transcriptomic analysis reveals insights on male infertility in Octopus maya under chronic thermal stress. Frontiers in Physiology 9:1920. doi: 10.3389/fphys.2018.01920

20. Vargas-Albores F, Martínez-Córdova LR, Gollas-Galván T, Garibay-Valdez E, Emerenciano MGC, Lago-Leston A, Mazorra-Manzano M, Martínez-Porchas M. (2019). Inferring the functional properties of bacterial communities in shrimp-culture bioflocs produced with amaranth and wheat seeds as fouler promoters.  Aquaculture 500: 107-117. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2018.10.005

 

19. Garibay-Valdez E., Martínez-Córdova L.R., Vargas-Albores F., Gollas-Galván T., Lago-Leston A., Calderón K., Martínez-Porchas M. (2018) Biofilm consumption shapes the intestinal microbiota of shrimp (Penaeus vannamei). Aquaculture Nutrition, 2018:1-9 DOI: 10.1111/anu.12868.

 

18. Vargas-Albores F., Martínez-Córdova L.R., Martínez-Porchas M., Calderón K. & Lago-Lestón A. (2018) Functional metagenomics: a tool to gain knowledge for agronomic and veterinary sciences. Biotechnology and Genetic Engineering Reviews. DOI: 10.1080/02648725.2018.1513230

17. Martinez-Cordova LR, Vargas-Albores F, Garibay- Valdez E, Ortiz-Estrada A M, Porchas Cornejo MA, Lago-Lestón A, Martinez-Porchas M. (2018). Amaranth and wheat grains tested as nucleation sites of microbial communities to produce bioflocs used for shrimp culture.  Aquaculture 447: 503-509

16. Rodrigues GN, Lago-Lestón A, Costa R, Keller-Costa T. 2018. Draft Genome Sequence of Labrenzia sp. Strain EL143, a Coral-Associated Alphaproteobacterium with Versatile Symbiotic Living Capability and Strong Halogen Degradation Potential. Genome Announc. 6(10). pii: e00132-18. doi: 10.1128/genomeA.00132-18.

15. Silva SG, Lago-Lestón A, Costa R, Keller-Costa T. 2018. Draft Genome Sequence of Sphingorhabdus sp. Strain EL138, a Metabolically Versatile Alphaproteobacterium Isolated from the Gorgonian Coral Eunicella labiata. Genome Announc. 6(9). pii: e00142-18. doi:10.1128/genomeA.00132-18 .

14. Keller-Costa T, Eriksson D, Gonçalves JMS, Gomes NCM, Lago-Lestón A, Costa R. 2017. The gorgonian coral Eunicella labiata hosts a distinct prokaryotic consortium amenable to cultivation. FEMS Microbiol Ecol. 93(12). doi: 10.1093/femsec/fix143.

13. Marfil-Santana MD; O'Connor-Sánchez A, Ramírez- Prado JH, De los Santos-Briones C, López-Aguiar LK, Rojas-Herrera R, Lago-Lestón A, Prieto-Davó A. (2016). A computationally simplistic poly-phasic approach to explore microbial communities from a Yucatan aquifer as potential sources of novel natural products. Journal of Microbiology 54(11):774-781

12. Keller-Costa T , Silva R , Lago-Lestón A, Costa R. (2016). Genomic insights into Aquimarina sp. EL33, a bacterial symbiont of the gorgonian coral Eunicella labiata. Genome Announcement, 4(4): e00855-16

11. Martins MJF, Lago-Lestón MA, Anjos A, Duarte CM, Agusti S, Serrão E & Pearson GA. (2015). A transcriptome resource for Antarctic krill (Euphausia superba Dana) exposed to starvation and UV-B. Marine Genomics, doi: 10.1016/j.margen.2015.04.008

10. Pearson GA, Lago-Leston A, Cánovas F, Cox CJ, Verret F, Lasternas S, Duarte CM, Agusti S, Serrão EA. (2015). Metatranscriptomes reveal functional variation in diatom communities from the Antarctic Peninsula. ISME Journal. doi:10.1038/ismej.2015.40

9. Lago-Lestón MA, Hardoim CCP, Cox C, Pires FR, Goncalves JMS, CJ, Xavier JBT, Costa R. (2013). Tackling the specificity of the marine sponge microbiome: a biogeographical approach. In Microbial diversity 2013: microbial interactions in complex ecosystems, pp 143-146. ISBN: 978-88-908636-5-3

8. Lago-Leston A, Mota C, Kautsky L, Pearson GA (2010). Functional divergence in heat shock response following rapid speciation of Fucus spp. in the Baltic Sea. Marine Biology, 157 (3): 683-688

7. Pearson GA, Hoarau G, Lago-Leston A, Coyer JA, Miller NJ, Kube M et al. (2010). A Expressed Sequence Tag (EST) analysis of the intertidal Brown Seaweeds Fucus serratus (L.) and F. vesiculosus (L.) (Heterokontophyta, Phaeophyceae) in response to abiotic stressors. Marine Biotechnology, 12 (2):195-213

6. Pearson GA, Lago-Leston A, Mota C (2009) Frayed at the edges: selective pressure and adaptive response to abiotic stressors are mismatched in low diversity edge populations. Journal of Ecology. 97 (3): 450-562g Ltd

5. Lago-Leston A, Ponce E, Muñoz ME (2007). Cloning and expression of hyperglycemic (CHH) and molt inhibiting (MIH) hormones mRNAs from the eyestalk of shrimps of Litopenaeus vannamei grown in different temperature and salinity conditions. Aquaculture 270: 343-357

4. Varela-Alvarez E, Andreakis N, Lago-Leston A, Pearson GA, Serrao EA, Procaccini G, Duarte CM, Marba N (2006) Genomic DNA isolation in green and brown algae (Caulerpales and Fucales) for microsatellite library construction. J. Phycol 42: 741-745

3. Pearson G, Lago-Leston A, Valente M and Serrao E (2006) Simple and rapid RNA extraction from freeze-dried tissue of brown algae and seagrasses. Eur J Phycol 41: 97-104

2. Lago-Leston MA, Serrao EA, Pearson, GA (2005). Comparative gene expression (population- and specie-level) during desiccation stress in an intertidal brown alga. Phycologia 44: 60-60

1. Fonseca VG, Lago-Leston A, Laize V, Cancela ML (2005) Rapid identification of differentially expressed genes by in situ screening of bacteria. Mol. Biotechnol. 30: 163-166

 

Tesis finalizadas

Castañeda Quezada, J.R. 2021. Identificación y distribución de quistes de reposo de Gymnodinium catenatum Graham en sedimentos superficiales de la parte norte del Golfo de California. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 98 pp. https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3652. En co-dirección con el Dr. Ernesto García (CICESE)

 

Cervantes Castillo, C. 2021. Análisis exploratorio de las comunidades metanogénicas de los volcanes de lodo del golfo de Cádiz. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 70 pp https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/3561

 

Sánchez Leyva, I.M. 2019. Estudio de las comunidades microbianas asociadas a ambientes geotermales de la falla Wagner, golfo de California. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 47 pp. .http://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2786

 

Barcelos Santiago, C. 2018. Caracterización de las comunidades microbianas presentes en los sedimentos de Perdido y Coatzacoalcos del Golfo de México mediante análisis metagenómicos. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 77 pp. https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2593

Pacheco Sandoval, A.M. 2017. El microbioma intestinal de la foca de puerto (Phoca vitulina richardii) y su relación con la dieta: caracterización mediante secuenciación masiva. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 83 pp. https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1734

 

Ariza Pérez, F.I. 2017. Análisis metagenómico de los microbiomas asociados a esponjas marinas del Parque Nacional Cabo Pulmo (BCS), dirigido a la búsqueda de genes involucrados en la síntesis de policétidos y péptidos no ribosomales con potencial actividad antimicrobiana. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 104 pp. https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/2041

Covarrubias Rodríguez, M.B. 2016. Caracterización de las comunidades microbianas en sedimentos del Golfo de México, mediante análisis metagenómicos. Tesis de Maestría en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California. 83 pp. https://cicese.repositorioinstitucional.mx/jspui/handle/1007/1337

Tesis en proceso

Pacheco Sandoval, A.M. La filogenia, la edad y el ciclo de vida: Factores que moldean la composición de la microbiota intestinal en la foca de puerto (Phoca vitulina richardii). Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada. En co-dirección con la Dra. Yolanda Schramm (UABC). Fecha tentativa de defensa: agosto 2022.

 

Sidón Ceseña, K.  Diversidad y función del fitoplancton en la zona eufótica del Golfo de México a partir de análisis metagenómico y metatranscriptómico. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada. Fecha tentativa de defensa: diciembre 2022.

Osorio Pando, Lizt S. S. Estructura y función de los procariontes en las aguas profundas del Golfo de México. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada. Fecha tentativa de defensa: marzo 2023.

 

Palomino Hermosillo, Y. Apatzingan. Sucesión de las comunidades microbianas en el lago cráter Santa María del Oro. Tesis de Doctorado en Ciencias. Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada. Fecha tentativa de defensa: diciembre 2024. En co-dirección con la Dr. Oscar U. Hernández Almeida (UAN).

 

Metagenomics@CICESE

Lago-Lestón Lab